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如何解读眼科遗传病基因检测报告

遗传性眼病不同于普通眼病,普通眼病可以通过药物或者手术控制甚至治愈,但是大部分的遗传性眼病目前没有有效的治疗药物,加之遗传性眼病危害的不是一个人,而是有血缘关系的整个家族,因此,对于遗传性眼病患者来说,遗传性眼病基因检测就显得非常重要。通过基因检测,可以帮助遗传性眼病患者明确致病基因,通过遗传阻断从家族中排除致病基因,让家族摆脱遗传性眼病的困扰。

 

针对很多患者反映,拿到检测报告看不懂的情况,本期给大家做一期详细的报告解读。

 

遗传性眼病基因检测报告分为基因检测报告遗传学分析报告两大部分,其中第一部分基因检测报告包括样本信息、检测信息、检测结果、家系图及家族验证;遗传学分析报告包括基因检测结果及相应的遗传解析,另附有疾病说明、参考文献、方法说明等。倘若检测到临床意义不明确但是有可能致病的变异就会在临床意义未名的变异附表呈现,遗传解析同样紧跟其后。最后是本项目检测的基因列表。

 

                                                                                     

跟大家一起解读这份报告

 

样本信息:即先证者信息(先证者即第一个来就诊的患者),家族史是鉴别诊断遗传性眼病患者重要指标,通过家族史问诊帮助医生初步判断。从检者一般是患者的直系亲属,患者检测结果结合从检者检测结果可以判断突变基因的父母来源,同时可以验证检测结果的准确性,提高检出率。

 

检测信息:包含检测项目和检测方法。检测项目根据患者的临床症状选择相应的检测项目。检测方法通常采用是靶向捕获。

 

 

检测结果:是报告的核心部分,包含检测到基因名称、参考序列、核苷酸改变、氨基酸改变、纯合还是杂合、致病性分析、遗传方式、变异来源。其中遗传方式主要包括常染色显性遗传(AD)、常染色体隐性遗传(AR)、和X连锁的隐性遗传(XLAR)等。找到突变基因(即核苷酸和氨基酸发生改变),分析该基因是否是患者的病因,还需要考虑突变基因的遗传方式和杂合纯合,比如,如果突变基因遗传方式是AD,那么杂合就能致病。反之,如果突变基因遗传方式是AR,那么纯合或者复合杂合才能致病。如示例报告中ABAC4基因,核苷酸改变是c.2894A>G,该基因编码区第2894位核苷酸的A变为G,导致翻译出蛋白改变p.Asn965Ser,即第965位的氨基酸由Asn变为Ser。先证者带有该基因的纯合突变,该基因遗传方式是AR,所以肯定是致病的。变异来源是确定突变位点是来源父亲还是母亲。

 

致病性分析是按照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)制定的遗传变异分类标准,变异分为以下5种类型,Pathogenic 表示致病的变异;Likely pathogenic 表示可能致病的变异;Benign 表示良性的变异;Likely benign 表示可能良性的变异;Uncertain significance 表示意义不明确的变异。我们在报告中只给出致病变异(Pathogenic)和可能致病变异(Likely Pathogenic)。良性、可能良性及意义不明确的变异都不呈现。

 

 

 

家系图:是根据先证者及从检者的信息,绘制家族亲缘与婚姻关系的图,通过家系图可以分析致病基因来源及在家族成员中的传递情况。上面基因检测的结果中先证者携带ABCA4基因的遗传方式是常染色体隐性遗传。从上图家系图中可以看到,先证者的母亲家族中有多个患者,先证者的姥姥是患者,先证者的母亲的兄弟姐妹中也有患者,推测先证者的姥爷及父亲是致病基因的携带者。先证者的妹妹及儿子未来必须借助产前诊断或者PGD技术避免患儿出现。

 

 

家族验证:通过分析从检者的致病基因的突变位点,明确先证者突变来源,同时进行分离验证确保分析准确性。

 

 

检测结果及遗传解析:检查结果是上面检测报告中得到的基因突变位点,遗传解析分析致病基因的突变位点是否致病,参考已有的文献报告分析致病突变是否是导致先证者患病的病因。并在其后附上文献参考依据。患者如果仍旧有不明的地方可以继续到医生遗传门诊咨询。

 

疾病说明:介绍疾病的临床症状及发展趋势供患者了解。

 

方法介绍及局限性:介绍基因检测采用方法的简要流程。任何方法都有使用范围,该方法不能发现基因大片段缺失和重复突变,亦不能完全发现基因位于内含子和UTR区的突变,未检测到致病突变并不能完全排除上述基因致病的。

 

 

临床意义未名的变异:多少情况下可以找到致病突变,或者明确根本没有找到致病突变,还有一种情况是找到突变位点但是该位点是否致病目前没有文献支持,并且利用现有的分析软件无法判断该位点是否致病。这些位点可供医生科研上进一步研究验证。